ゲーム中に出現する、「予め建っている遺産」。前作では全て1タイルだったが、本作では自然遺産によって占有サイズが違う。
発見すると「占星術」のひらめきと時代スコア+1（主要文明で最初に発見した場合は+3）を得る。
初期に発見すれば宗教創始のチャンスが広がり、古典時代の暗黒時代入り回避に役立つだろう。
また、都市国家キャンディの宗主国である場合宗教遺物を得られる。
キリマンジャロなどの山岳風の自然遺産タイルにユニットは侵入できない。
しかし、山岳風であって山岳扱いではないらしく、区域の山岳隣接ボーナスを得られず、用水路が作れない。
自然遺産は全て「周囲のタイルにアピール+2」の特性がある。
どんな不毛の砂漠や極寒の極地にあってもアピールがあるため自然公園を建造するのに最適。だが、海上の自然遺産はどうやっても囲めない点に注意が必要。
前作のクラタカウのような無茶な出現は減ったものの、やはり場所によっては活用しづらかったり都市国家が占有したりする。
| 地形 | 出力 | サイズ | 追加効果 | 出現立地 | |
|---|---|---|---|---|---|
 | ドーバーの崖 |  文化力+3 ゴールド+2 | 2タイル | 通行可 隣接タイルのアピールが通常の+2ではなく+4。 | 沿岸 |
 | クレーターレイク |  科学力+1 信仰力+4 | 1タイル | 周囲のタイルに真水を供給 | |
 | 死海 | 文化力+2信仰力+2 | 2タイル | 通行可 隣接ユニットが回復すると全回復する | 砂漠 |
 | ガラパゴス諸島 | - | 2タイル | 隣接タイルの科学力+2 | 近海*1 |
 | グレートバリアリーフ |  食料+3科学力+2 | 2タイル | 通行可 | 沿岸 |
 | エベレスト山 | - | 3タイル | 隣接タイルの信仰力+1 隣接した宗教ユニットに高地訓練を与える | 山脈 |
 | キリマンジャロ山 | - | 1タイル | 隣接したタイルの食料+2 火山。滅多に噴火しないが、常に活動している。 | 山脈 |
 | パンタナル | 食料+2文化力+2 | 4タイル | 湿原扱い、通行可 | 草原 |
 | ピオピオタヒ | - | 3タイル | 隣接したタイルの文化力+1、ゴールド+1 | |
 | トーレス・デル・パイネ | - | 2タイル | 隣接タイルの地形・地物からの総出力2倍 | |
 | ツィンギ・デ・べマラ | - | 1タイル | 隣接タイルの科学力+1、文化力+1 | |
 | ヨセミテ | - | 2タイル | 隣接タイルの食料+1、科学力+1、ゴールド+1 | |
| 地形 | 出力 | サイズ | 追加効果 | 出現立地 | |
|---|---|---|---|---|---|
 | エイヤフィヤトラヨークトル | - | 2タイル | 隣接する土地の文化力+1、食料+1 火山。滅多に噴火しないが、常に活動している。 | 極地 |
 | ジャイアンツ・コーズウェー | - | 2タイル | 隣接した陸上ユニットが昇進「フィオンの槍」( 戦闘力+5)を得る。 | 沿岸 |
 | リースフィヨルド | - | 3タイル | 初めて隣接した海洋軍事ユニットは直ちにレベルアップする。 | 極地 |
| 地形 | 出力 | サイズ | 追加効果 | 出現立地 | |
|---|---|---|---|---|---|
 | ウルル | - | 1タイル | 隣接タイルの文化力+2、信仰力+2。隣接タイルのアピールが通常の+2ではなく+4。 | 砂漠 |
| 地形 | 出力 | サイズ | 追加効果 | 出現立地 | |
|---|---|---|---|---|---|
 | ハロン湾 | 食料+3 生産力+1文化力+1 | 2タイル | タイル内での防衛戦で海洋軍事ユニットの戦闘力+15。 | 沿岸 |
| 地形 | 出力 | サイズ | 追加効果 | 出現立地 | |
|---|---|---|---|---|---|
 | デリケート・アーチ | - | 1タイル | 隣接タイルの信仰力+1、ゴールド+1 | 砂漠 |
 | レトバ湖 | 文化力+2ゴールド+2生産力+1 | 2タイル | - | ? |
 | ロライマ山 | - | 4タイル | 隣接タイルの信仰力+1、科学力+1 | ? |
 | サハラの目 | 生産力+2科学力+1 原子力時代以降はさらに 生産力+1科学力+3 | 3タイル | - | ? |
 | マッターホルン | - | 1タイル | 隣接タイルの文化力+1、隣接した陸上戦闘ユニットは丘陵の移動コストを無視し、丘陵で+3の戦闘力ボーナスを得る | |
 | ウヴス・ヌール盆地 | 信仰力+2食料+1生産力+1 | 4タイル | ||
 | 張掖丹霞 | - | 3タイル | いずれか1つ以上のタイルを所有している場合、 大将軍ポイント+2、大商人ポイント+2 | |
| 地形 | 出力 | サイズ | 追加効果 | 出現立地 | |
|---|---|---|---|---|---|
 | イキル | - | 1タイル | 隣接タイルに遺産や区域を建造するとき生産力+50％、真水を供給する | 草原、平原 |
 | ヴェスヴィオ山 | - | 1タイル | 隣接タイルの生産力+1。 火山。噴火による人口減少と恩恵が大きい。常に活動状態にある。 | 草原か平原の山岳 |
 | ゴブスタン | 文化力+3生産力+1 | 3タイル | - | 平原 |
 | サハラ・エル・ベイダ | 科学力+1文化力+1ゴールド+4 | 4タイル | - | 砂漠 |
 | チョコレート・ヒル | 食料+1科学力+1生産力+1 | 4タイル | - | 草原、平原 |
 | パムッカレ | - | 2タイル | 快適性＋1，総合娯楽施設が隣接していると快適性＋1，劇場広場、キャンパス、商業ハブの各区域に大きな隣接ボーナスを与える。聖地区域に通常の隣接ボーナスを与える。真水を供給する。 | ツンドラ・雪原以外 |
 | マト・ティピラ | - | 1タイル | 隣接するタイルは信仰+1生産力+1 | 雪原以外 |
| 地形 | 出力 | サイズ | 追加効果 | 出現立地 | |
|---|---|---|---|---|---|
 | パイティティ | - | 3タイル | 隣接するタイルのゴールド+3、文化力+2 劇場広場と商業ハブ区域に大きなの隣接ボーナスを与える。 このタイルがある都市は、他文明に向かう  交易路からのゴールド+4。 | ツンドラ・雪原以外 |
 | バミューダトライアングル | - | 3タイル | 隣接するタイルの科学力+5 このタイルに入った海洋ユニットは遠くの外洋タイルに飛ばされるが、昇進「神秘の海流」(  移動力+1) を得る。 | 外洋 |
 | 若返りの泉 | 科学力+4信仰力+4 | 1タイル | 陸上軍事ユニットがこのタイルに入ると、昇進「命の水」(どの領土でも回復時のHP+10) を得る。真水を供給する。 | ツンドラ・雪原以外 |
